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La valiosa información generada por la tecnología proteómica contribuye, entre otras, al desarrollo de:
- La biomedicina, en aplicaciones como la búsqueda de biomarcadores para el diagnóstico de enfermedades y de dianas terapéuticas; así como el desarrollo de fármacos y vacunas.
- La biotecnología agraria, en el desarrollo de biopesticidas y biofertilizantes que mejoren los rendimientos de la producción y la calidad medioambiental de los suelos; así como el análisis de residuos y contaminantes en la industria agroalimentarias.